Puerto Villamil es una pequeña villa y puerto situada en el borde sureste de la Isla Isabela, en las Islas Galápagos, Ecuador.

De las 2.200 personas que viven en Isabela, la mayoría vive en Puerto Villamil. El puerto, con frecuencia está lleno de barcos de vela, ya que Villamil es una parada popular para los yates privados que se dirigían a las Islas Marquesas, ya que es la ciudad más occidental de las Islas Galápagos.

Tradicionalmente los residentes de Puerto Villamil se han ganado la vida a través de la agricultura o la pesca. El gobierno ha tomado ciertas medidas para diversificar las actividades más allá de la pesca, como por ejemplo promoviendo el turismo.

En el extremo suroeste de la ciudad, se creo un paseo por el parque con ayuda de los Estados Unidos. Conduce a través de ambientes de manglares pasando por lagunas de agua salada habitada por flamencos, teros, zarapitos, patos gargantilla, y gallinulas que vienen aquí a barrer el lodo.